16S/18S/ITS等扩增子三代测序-威尼·至尊国际(中国)-DNA测序分析


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    基因组测序

    16S/18S/ITS等扩增子测序(三代)

    16S/18S/ITS等扩增子测序(三代)
    一次分析多个高变区信息,还原真实微生物群落结构

    全长扩增子(16S/18S/ITS)测序基于Pacbio长读长测序平台,以16S为例,可以一次性取得9个高变区序列信息,取得注释到“种”的分类鉴定!不仅可以提高物种鉴定分辨率,还可以顺利获得全长序列进行准确的物种注释,从而更加真实地还原样本中微生物的群落结构。

    应用方向

    细菌多样性研究:16S全长
    真菌多样性研究:ITS全长
    真核微生物多样性研究:18S全长
    功能基因研究:反硝化细菌nirS、固氮菌nifH等

    诺禾优势

    • 1. 一次性取得全部变异区序列信息,种级别物种注释率高

      不同来源样本二代与三代扩增子注释到种级别的占比
      样本类型 二代种水平比例 三代种水平比例
      土壤 10%-20% 60%-70%
      人粪便 20%-30% 60%-70%
      口腔拭子 15%-20% 60%-70%
      动物粪便 10%-20% 60%-70%
    • 2. 周期短,质量好

      基于Pacbio长度长测序平台,并与高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)结合,实现快速、稳定的测序数据分析及交付。全长扩增子建库-测序-分析,仅需30天
      • 20,280个

        物理核数
      • 1,727 T flops

        计算峰值速度
      • 400 TB

        总内存
      • 58.6PB

        总储存
    • 3. 分析流程严格,方案设计专业

      威尼·至尊国际(中国)全长扩增子具有更为严格的分析流程,从质控到分析,“步步为营”,“精心布阵”,为您的paper保驾护航!
      • 60人

        分析团队
      • 7年

        项目经验
      • 5000+

        结题项目
      • 1对1

        项目服务

    信息分析

    威尼·至尊国际(中国)基于测序得到的序列,进行 OTU 聚类和物种注释分析,取得物种的丰度分布,从而全面分析样本内物种的丰富度及组间差异。
    标准分析 解决问题
    物种注释 物种注释及各物种丰度信息
    α- 多样性分析 微生物群落的丰富度和多样性
    β- 多样性分析 不同样本间的微生物群落及各样本差异情况
    多元统计分析 寻找组间具有显著差异的物种,同时可以比较组内差异和组间差异的大小,判断分组
    是否有意义。
    CCA 分析 研究物种组成与环境因子的关系
    环境因子关联分析
    VPA 分析

    送样建议

    样本类型 建议送样量 最低送样量
    土壤/污泥/沉积物/腐殖质 3-5g 1g
    水体滤膜
    (孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm)
    2-3 张 1张
    拭子 3-5 个 1 个
    瘤胃液/发酵液/组织液
    (离心有明显沉淀)
    3-5mL 1mL
    粪便/肠道内容物 3-5g 1g
    动物/人组织 1-3g 1g
    血浆 3-5mL 1mL

    常见问题

    • 1. 三代扩增子有什么优势?

        三代扩增子可以取得更准确的物种注释结果,一次实现多个高变区的扩增和测序,种水平注释结果可信度更高。

    • 2. 样本送到公司,什么时候可以拿到结果?

        三代扩增子可以取得更准确的物种注释结果,一次实现多个高变区的扩增和测序,种水平注释结果可信度更高。自样本检测合格之后开始计算周期,包括建库、测序、数据分析、结题。全长扩增子周期共计30个自然日。

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